Στο 4ο εξάμηνο του Προγράμματος προβλέπεται η εκπόνηση μεταπτυχιακής διπλωματικής εργασίας. Η Συντονιστική Επιτροπή, ύστερα από αίτηση του/της υποψηφίου/ας, στην οποία αναγράφεται ο προτεινόμενος τίτλος της διπλωματικής εργασίας, ο/η προτεινόμενος επιβλέπων/ουσα και επισυνάπτεται περίληψη της  προτεινόμενης εργασίας, ορίζει τον/την επιβλέποντα/ουσα αυτής και την τριμελή εξεταστική επιτροπή για την έγκριση της εργασίας.

Ο/Η Επιβλέπων/ουσα και τα μέλη της τριμελούς εξεταστικής επιτροπής της Μεταπτυχιακής Διπλωματικής Εργασίας μπορεί να είναι μέλη Δ.Ε.Π. και διδακτικό προσωπικό του Π.Μ.Σ.

Το αντικείμενο της μεταπτυχιακής διπλωματικής εργασίας πρέπει να είναι σε θέμα συναφές με τα μαθήματα του προγράμματος. Πρέπει να είναι ατομική, πρωτότυπη, να έχει ερευνητικό χαρακτήρα ή να αποτελεί εργασία ανασκόπησης προηγούμενων μελετών, εφόσον δεν υπάρχει αντίστοιχή της στη διεθνή βιβλιογραφία.  Η γλώσσα συγγραφής της μεταπτυχιακής διπλωματικής εργασίας μπορεί να είναι η ελληνική ή η αγγλική γλώσσα, με ελληνική και αγγλική περίληψη και στις δύο περιπτώσεις.

Η διπλωματική εργασία, η οποία κατατίθεται στο τέλος του 4^ου εξαμήνου, εγκρίνεται από τον επιβλέποντα/ουσα καθηγητή/τρια και στη συνέχεια υποστηρίζεται δημόσια ενώπιον της τριμελούς εξεταστικής επιτροπής.

Για να εγκριθεί η μεταπτυχιακή διπλωματική εργασία, πρέπει να βαθμολογηθεί βάσει της δεκαβαθμιαίας κλίμακας (1-10) με βαθμό κατ’ ελάχιστο πέντε (5). Η αρνητική ψήφος αιτιολογείται εγγράφως. Αν η μεταπτυχιακή εργασία θεωρείται από την επιτροπή μη ικανοποιητική και βαθμολογηθεί κάτω από τη βάση του 5, τότε η επιτροπή μπορεί να ζητήσει από τον μεταπτυχιακό φοιτητή τη βελτίωσή της, την τροποποίηση ορισμένων τμημάτων ή τη ριζική αναμόρφωσή της. Στην τελευταία αυτή περίπτωση, η επιτροπή ορίζει συγκεκριμένο χρονικό πλαίσιο μέσα στο οποίο πρέπει να έχει επανυποβληθεί η μεταπτυχιακή εργασία, τροποποιημένη σύμφωνα με τις υποδείξεις της.

Οι μεταπτυχιακές διπλωματικές εργασίες εφόσον εγκριθούν από την εξεταστική επιτροπή, αναρτώνται υποχρεωτικά στο Ψηφιακό Αποθετήριο "ΠΕΡΓΑΜΟΣ", σύμφωνα με τις αποφάσεις της Συγκλήτου του Ε.Κ.Π.Α..